L'Ordre 66 est un des tournants de l'histoire de Star Wars. Il se déroule en 19 av.BY, soit en plein épisode III.

L'Ordre 66 fait partie des événements constitutifs de la Grande Purge Jedi.

Après avoir tué Mace Windu et enfin amené Anakin Skywalker du côté obscur, Palpatine ordonne aux soldats clones d'exécuter tous les Jedi, même les Youngling et les Padawan. C'est la fin présumée de l'Ordre Jedi et la victoire des Sith et de l'Empire.

Un message codé (créé par l'Empire) envoyé à tous les Jedi les invite à rejoindre le Temple Jedi. Les clones y sont postés pour les traquer et les exterminer.

Certains Jedi parviennent à survivre à l'Ordre 66 : les plus importants sont Yoda et Obi-Wan Kenobi, qui se rendent ensuite au Temple pour pouvoir changer le message codé et inciter les Jedi survivants à se cacher.

Le film Episode III montre plusieurs exécutions de l'ordre 66 : Aayla Secura, Ki-Adi-Mundi, Plo Koon, Stass Allie ; Yoda et Obi-Wan Kenobi y survivent.